战斗的过程异常激烈。蚩尤部落的装备优势明显，炎黄联军则人多力量大。
传说除了当面互砍之外，双方还掌握了不少充满想象力的神器。比如能改变战场环境的“气象武器”，传说中蚩尤请出风伯雨师召唤狂风暴雨，想要用滔滔巨浪把炎黄联军一冲而散，而黄帝就找来天女魃抗洪抢险。
战斗进行到最关键的阶段，蚩尤吐出迷雾笼罩整个战场，打算把联军困死其中，因为就算神农氏粮仓充足，粮食也总有吃完的一天。
这场大雾笼罩了战场三天三夜，结果黄帝发明了指南车，最终辨明方向，突出重围。这迷雾日夜不散，不像气象武器的副产品，反而有点像冶炼工业所带来的空气污染。结合蚩尤部落冶炼金属的传说，他们能创造出如此浓密的烟雾倒也合乎逻辑。
双方你来我往，黄帝九战九败，最后是靠着神女的帮助才终于获胜。传说黄帝将打败的蚩尤戴上枷栲，砍下他的头颅，把他的身体和首级分开埋葬。蚩尤死后，他身上的枷栲落在地上，变成了一种树，每到秋季就叶红似血，每一片叶子都是蚩尤的血所染成，这种树就是枫树。
获胜之后，黄帝成了真正的天下之主，蚩尤部落大部分融入炎黄集团，少部分南下成为南方黎族、苗族的祖先，我们总说的黎民百姓，黎民就是九黎氏族之民。
因此所谓华夏民族，其实应该是炎帝、黄帝和蚩尤三个部族融合的产物。
后来黄帝尊蚩尤为“兵主”，即战争之神。按照《史记·封禅书》所记载，古代君主封禅时要祭祀八个神主，第一是天主，第二是地主，第三是兵主——祭祀的就是蚩尤；而古代华夏的军旗上，画的也是蚩尤的画像。所以长期以来，蚩尤和黄帝、炎帝一样，都被视作华夏的始祖，是个非常正面的形象。
蚩尤旗
传说中黄帝把蚩尤的形象画在战旗上以震慑敌军，这就是蚩尤旗。但大多数时候，蚩尤旗指的是一种彗星。
《晋书·天文志》记载：“蚩尤旗，类彗而后曲，象旗。”注释中提到这是一种专属于“荧惑”的妖星，代表战争和杀戮的降临。荧惑，即火星，古巴比伦认为它是死亡之星，古罗马神话中火星就是战争之神玛尔斯。
可见人类的思维的确是相通的。
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